擬似量子アニーラで相関係数に基づく特徴量選択を行う
はじめに（何をしたいか） タイトルの通り、この記事では、擬似量子アニーラを用いて、相関係数に基づく特徴量を選択する方法について、説明します。 擬似量子アニーラ 擬似量子アニーラとは、もって回った...
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Pymatgenチュートリアル⑥ XRDのシミュレーションをする
はじめに https://qiita.com/ojiya/items/e98a9dd5cb6cd7ad38ca や https://qiita.com/ojiya/items/37b594150...
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Pymatgenチュートリアル④ 構造を扱う
はじめに 材料研究とX線回折（X-ray diffraction、XRD）パターンの測定・解析は、切っても切り離せない関係にある。というか、「材料粉体を合成したら、まずはXRD」が基本中の基本と...
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アニーリングマシンにとても簡単な問題を解いてもらう
背景 一昔前は、「量子コンピュータ」というと、すごく未来的なものだと感じていたが、ここ数年で、一気に「民主化」が進んできた感覚がある。この一因として、量子コンピュータ「関連技術」の広がりがある。...
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Pymatgenチュートリアル⑤ Structure型のデータを作る
はじめに 前回の記事（https://qiita.com/ojiya/items/e98a9dd5cb6cd7ad38ca ）に引き続き、PymatgenとOptunaでXRDの解析を目指す。前...
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Orange3を使ってGUIで機械学習に入門する
はじめに ひょんなことから、"Orange3"というGUIベースの機械学習用ソフトウェアの存在を知った。どうやら、Scikit LearnとScipyでできることは大体できる、というソフトウェア...
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Starry DataとXenonpyで意識の低いマテリアルズインフォマティクスをする② 記述子を削減する
はじめに この記事で書くこと この記事は、以下の記事の続きである。 上の記事に書いたように、意識の低いマテリアルズインフォマティクスをやりたい。この記事では、前回作成した記述子を減らして、回帰や...
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Starry DataとXenonpyで意識の低いマテリアルズインフォマティクスをする① ヒートマップを描く
はじめに この記事で書くこと この記事は、材料系かつ実験系の研究者が機械学習を始めるための第一歩になりそうなことを書く。「マテリアルズインフォマティクス」という言葉が人口に膾炙し、「未知の材料の...
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PymatgenでABINIT入力ファイルを作成し、自動実行する
はじめに この記事で書くこと Pymatgenには、Quantum EspressoやABINITをはじめとする、各種計算用の入力ファイルを作成する機能が付いているが、使い方についての情報がほと...
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Pymatgenチュートリアル番外① Pymatgenで作った構造をVESTAで表示する
はじめに この記事で書くこと この記事は、チュートリアル③の次に相当する。 チュートリアル③では、pymatgenを使って、cifファイルを読み込み、金属サイトとその周りの酸素を切り出すというこ...
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Pymatgenチュートリアル③ cifファイルを扱う
はじめに この記事で書くこと チュートリアル②では、化合物を検索して、cifファイルを保存することができた。 そこで、この保存したcifファイルから、いろいろとデータを取り出してみたい。いろいろ...
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Pymatgenチュートリアル② Materials Projectのデータを持ってくる
はじめに この記事で書くこと 前回は、一番基本的な使い方ということで、ElementとCompositionについて書いた。 この記事では、Materials Projectからデータを引っ張っ...
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Pymatgenチュートリアル① 化合物の情報を取り出す
はじめに この文章を書いた理由 ここでは、材料化学の研究者の視点から、「Pymatgen」というライブラリの使い方をまとめていく。このライブラリそのものの説明に関しては、例えば以下のサイトに詳し...
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