Visual Studio Codeでjupyter notebookのipynbファイルを開く
VS codeが一番楽 ipynbファイルを開く方法はいくつかある． ブラウザ（ターミナルからjupyter notebook or jupyterlabを起動） JupyterLab Desk...
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ASEとCrySPYでサクッと結晶構造探索
はじめに CrySPY: Python製の結晶構造探索ツール．https://tomoki-yamashita.github.io/CrySPY_doc/ja/index.html ASE: 第...
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物性研スパコンohtakaで結晶構造探索を行う
はじめに 物性研スパコンのohtakaでCrySPYとQuantum ESPRESSOを使って結晶構造探索を行う． 動作確認程度のチュートリアル．詳細はドキュメントを参照してほしい． Pytho...
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Macを買ったらやること
目的 仕事やプライベートで何度かやることになりそうなのでここで記録しておく． 研究でいつも使ってる状態にするまでの記録． 初回起動 wi-fi，icloud，siri，指紋とか言われるがまま進め...
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MacにTeX環境構築
バージョンなど macOS Big Sur バージョン 11.0.1 MacBook Air (M1, 2020) tlmgr revision 57119 (2020-12-13 00:40:...
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MacにHomebrewをインストールしていくつかパッケージを入れる
Homebrewをインストールする準備 Command Line Tools for Xcode ====== 2022/12/15 追記 ====== M2 MBA macOS Ventura...
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EmacsをHomebrewでインストールしてMac特有の設定をする
バージョンなど macOS Big Sur バージョン 11.0.1 MacBook Air (M1, 2020) Emacs 27.1 (Emacs Mac PortのHomebrew版) R...
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Macでバックスラッシュとアクセント記号付き文字を打つ方法
====== 2022/12/16 追記 ====== 日本語-ローマ字入力を選択して，入力モード:で英字にもチェックを入れる． この設定はやめて，Karabiner-Elementsで\と¥を...
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MacにKarabiner-Elementsを入れてEmacsとの親和性を高める
Karabiner-Elements Karabiner-Elements キーマップを変更できるソフト．誰かが用意してくれたセッティングなどもWEBから簡単にインポートできる． Emacsを使...
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elpyを使ってEmacsのpython環境を構築する
elpy EmacsをPythonのIDEにするようなもの．補完とか文法チェックとか色々できるようになる． インストールと設定 melpaとかからインストールする． 下記は use-packag...
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Emacsでgrepする方法（helm-agとripgrep)
久しぶりに使おうとするとやり方をいつも忘れているのでメモしておく． Emacsのhelm-agからripgrepとかいう高速にgrepできるツールを使う． 事前準備 ripgrepのインストール...
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argparseのノート
narg nargs=*で引数が無い時の挙動が位置引数とオプション引数で違う． python test.py parser = argparse.ArgumentParser() parser....
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Emacsのorg-mode
見た目の設定 Emacsを新しく入れたら，挙動が新しくなったのか.orgファイルをEmacsで開くと文章が展開された状態になっていた． 前までは全ては展開されず，見出しだけ展開されていたような気...
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Git Credential ManagerでGitHubの認証情報をキャッシュする
Git Credential Manager 最近はGithubへpushしたりするときに認証が必要．前はトークンを発行したりしていたが，MacではGit Credential Managerを...
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Macでrmtrashの代替とLinuxでのrmの置き換え
rmtrashがHomebrewでインストールできなくなった ライセンスが不透明で作者のレスポンスがないのでHomebrewから最近外されたらしい． https://github.com/Hom...
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Big Surでライブラリのパスが通ってなくてコンパイルエラーが出る
環境 macOS Big Sur 11.1 MacBook Air (M1, 2020) Command Line Tools 12.3 Rosetta 2 使用 homebrewで入れたgcc...
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HomebrewのPythonのバージョンを変える
HomebrewのPythonがいつの間にかPython 3.9になっている brewのアップデートが入るとPythonが勝手に3.9になる．Python 3.9は新しくて対応してないパッケージ...
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ArmのMacでiTerm2の設定
環境 macOS Big Sur バージョン 11.0.1 MacBook Air (M1, 2020) iTerm2 3.4.3 （しばらくはRosetta2を使用） iTerm2の設定 Ro...
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Linux, Mac (BSD系), Macにcoreutilsを入れた場合に対応するlsの色付け設定
やりたいこと LinuxでもMac(coreutils有り無し)でも同じ.zshrcを使ってlsの色付け設定をする． LS_COLORS LinuxのGNU版lsコマンドの色設定は環境変数LS_...
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