pyenvとanacondaを共存させる時のactivate衝突問題の回避策3種類
python環境構築決定版の補足です。 20180312追記 2017-12-20付けでリリースされたconda 4.4.0でconda activateが採用されたようです。 conda/CH...
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pythonの内包表記を少し詳しく
pythonの内包表記について [nbviewer] (http://nbviewer.jupyter.org/format/slides/github/y-sama/comprehension...
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シェル芸勉強会 meets Python
イントロダクション シェル芸勉強会 meets バイオインフォマティクス vol.1 - connpass ## 背景 NGS現場の会MLで突如盛り上がったawkでデータを処理する手法について...
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pandasでデータ可視化
既に先行記事がありますが、pandasにはデータ可視化機能が備わっています。 matplotlibの薄いラッパーですが、これを使えば基本的なグラフのコードがかなり端折れます。 Pandasを用い...
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chromebookへのminicondaインストール (chromebrew+git使用)
chromebrewでgitが直接入れられることに気づいたので作成。 こっちよりスマートかも。 chromeosは色々権限の問題があるので、少し変化球が必要。 chromebookは ASUS ...
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condaにないパッケージをanaconda.orgにアップロードして管理する
Introduction condaでインストールできないパッケージは、通常pipでインストールしますが、condaでパッケージをbuildして管理することも可能(なはず)です。 このやり方だけ...
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Cloud9で簡単Jupyter環境構築
超簡単設定 超簡単バージョンを作りました。 https://github.com/y-sama/cloud9 主に、Jupyter, Pandas, Scikit-learn, tensorfl...
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データサイエンティストに向けたコーディング環境Jupyter Notebookの勧め
データサイエンティスト記事第二弾ww データサイエンティストのためのデータ解析環境 データサイエンティストとかいう人たちはプレゼンしたり、データを見ながらディスカッションしたりする機会が多いんだ...
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chromebookにnode.jsを入れる
モチベーション これを試したくて、chromebookにnode.jsを入れようと思いました。 備忘録&node.js初心者なので、検証不十分です。 詳しい方いらしたら、よろしくです。 ...
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データサイエンティストを目指す人のpython環境構築 2016
pythonの環境構築について "python 環境構築"でググると20万件くらいヒットしますが、割と内容が古いです。 タイトルにはデータサイエンティストと書いてありますが、データサイエンティス...
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ズンドコキヨシ with python / ruby / Lua
元ネタ 正直これを思いつくのがスゴい。 fizzbuzzより少し複雑なので言語の勉強によい気がする。 python版 最終コード 基本的なところで間違っていたので、指摘をいただきました。 あわせ...
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Jupyter Notebookを動的に使ってみる
現在の環境 ASUS C300 Chrome OS(linux-64) miniconda3-3.18.3 python 3.5.1 jupyter 4.0.6 chromebrew+gitイン...
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AWS純正のCfnClusterを使ってHPC on AWSを簡単に構築する
CfnClusterとは? AWS上でクラスタマシンを簡単に構築できるツール Starclusterの公式版 Getting startedはこちら 環境構築 現在の環境 ASUS C300 C...
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1時間で in houseにChEMBL検索環境を構築する
dumpファイルのダウンロード chembl_21_postgresql.tar.gzをダウンロードして、 vagrantの実行フォルダにおいておく。 (1.1GBあるので、結構時間かかる。) ...
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crouton環境構築メモ 2015.08.04 #自分用備忘録
2015.8.6 r-iRkernelのインストールについて追記 2015.8.23 r-iRkernel部分更新、iRubyインストール追記 [jupyter関連はこちら] (http://q...
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StarClusterの環境構築 作業メモ
イントロダクション このblogの記事によくまとまっています。 StarClusterはMITが開発したツールで、お手軽にAWS EC2上にクラスタマシンを作ってくれます。EC2でクラスタを形成...
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jupyter 4.0のパスワード設定
jupyter インストール anaconda一択 config周りについて jupyter 4.0でconfig周りが結構変わったようなので要確認 https://jupyter.readth...
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RDkitをpython 3にインストールする (ubuntu)
RDkitのインストール 2015/08/23現在 python3用rdkitはcondaを使ってbuild可能 参考URL conda install conda-build git clon...
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