z-score
z-score：データの平均からの偏差を標準偏差で割ったもの。具体的には、以下のように計算される： data = np.array([10, 20, 30, 40, 50]) def zscor...
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データポイントのばらつき（標準偏差）とサンプル平均のばらつき（標準誤差）
i). データポイントのばらつき（標準偏差） まず、データポイントのばらつきを計算する。これがサンプルの標準偏差 ( s )。 例）あるクラスの学生のテストの点数を考える。以下のデータがあるとす...
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密行列と疎行列
1. 見た目上の行列（4x3） ほとんどの要素が 0（ゼロ） matrix = [ [5, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 8] ] 2. 保存方法の違い ■...
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RNA velocityとは何か
RNA velocityとは何か？単一細胞の未来を予測する手法 RNA velocityは、単一細胞RNAシーケンス（scRNA-seq）データから、細胞の将来的な状態変化を予測するための手法。...
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ゲノム関連データベースメモ
ゲノム関連データベースまとめ 1. INSDC三大機関（塩基配列データベース） 地域 機関 略称 主なID 日本 DDBJ DDBJ DRA, DRR, DRX, DRS アメリカ NCBI ...
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Σx+ΣyがΣΣzみたいになるやつの理解のメモ
複数の総和（シグマ）を抽象化して1つにまとめる方法 〜「りんごとバナナの売上データ」から学ぶ数式の一般化〜 背景 たとえば、以下のような売上データがあるとする： りんごの売上（2日分）：x₁ =...
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Rのapply関数ファミリー
Rには、データフレームや行列に対して関数を適用するための便利な関数群がある。これらは「applyファミリー」と呼ばれ、それぞれ異なる用途に特化している。以下に主要な関数とその略語の意味、使い方を...
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pandasのブールインデクシング
pandasのブールインデクシング pandasのデータフレームに対してブール値のSeriesを使ってフィルタリングする方法をブールインデクシングと呼ぶ。これは特定の条件に基づいてデータフレーム...
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P(A ∩ B) = P(A|B) * P(B) がわからん。条件付き確率
同時に起こる確率 P(A ∩ B): AとBが同時に起こる確率 P(A|B): Bが起こったときにAが起こる確率 P(B): Bが起こる確率 例： Bが起こる確率が50%（P(B) = 0.5）...
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メソッド３種盛
インスタンスメソッド: クラスのインスタンスに関連付けられたメソッド。 クラスで定義されてインスタンスで呼び出す。 例: class MyClass: def instance_method(s...
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if __name__ == "__main__":
モジュールとスクリプト スクリプト: プログラムとして直接実行されるPythonファイル。 モジュール: 他のPythonファイルからインポートされるライブラリやユーティリティを含むファイル。 ...
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ipywidgets
1. Dropdownウィジェット import ipywidgets as widgets selection_list = widgets.Dropdown( options=['選択肢1'...
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フォーマット指定子
format文やf-stringsでのフォーマット指定子の種類。 数値のフォーマット ゼロ埋め: number = 7 print(f"{number:02}") # 2桁のゼロ埋め prin...
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@dataclassデコレータとfield
素人のメモなのでたぶんあってますくらい。 デコレータについては他記事で補完してください。 まずは@dataclassの話 @dataclassデコレータ：Pythonでクラスを簡単に作ることがで...
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iterrows() と itertuples() の違い
iterrows() 戻り値: 各行を (インデックス, Series) のタプルとして返す 速度: 比較的遅い 使い方: 各行を Series として操作したい場合に便利 出力例 import...
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python仮想環境のディレクトリ備忘録
普通のインストールとvenvの仮想環境のインストールの比較 venvではvenv/bin/pythonが../lib/python3.9/pythonのシンボリックリンクになっている / # ...
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