pandasのブールインデクシング

pandasのブールインデクシング

pandasのデータフレームに対してブール値のSeriesを使ってフィルタリングする方法をブールインデクシングと呼ぶ。これは特定の条件に基づいてデータフレームの行を選択する。

基本的な例

まず、サンプルデータフレームを作成する：

import pandas as pd

data = {
    'gene_name': ['gene1', 'gene2', 'gene3', 'gene4'],
    'log2FoldChange': [2.5, -1.2, 0.5, 3.0],
    'p-value': [0.01, 0.2, 0.05, 0.001]
}
df = pd.DataFrame(data)

次に、p-value 列の値が0.05未満である行を選択するためのブールインデクシングを行う：

selected_pval = 0.05
condition = df['p-value'] < selected_pval
df_filtered = df[condition]

condition は以下のようなブール値のSeriesになる：

0     True
1    False
2    False
3     True

df[condition] という構文により、condition が True の行のみが選択され、新しいデータフレーム df_filtered が得られる：

  gene_name  log2FoldChange   p-value
0     gene1             2.5  0.010
3     gene4             3.0  0.001