githubのコードでの不明点について
解決したいこと
https://colab.research.google.com/github/kecosz/EcohNet_py/blob/main/ecohnet_script.ipynb
上記のgithubのコードについて質問です。
コードを実行すると、本来であれば紫と黒から構成される正方形のグラフが表示されるのですが、私が実行してみたところ下記の写真のようになってしまいます。
何卒宜しくお願い致します。
本来のグラフ
私のグラフ
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3Answer
データが足りないように見えます。 https://github.com/kecosz/EcohNet_py/blob/main/ecohnet.ipynb に従ってセットアップしましたか？特に Set import and export folder セクションに書いてあるインポートフォルダの設定か、 Analysis セクションに書いてあるサンプルデータの CSV が不足している感じがします。
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@asunasota
Questioner
コメント頂きありがとうございます。一度その個所を再度確認してみます。
GitHubリポジトリのReadmeは確認してみましたか？
external/wolfram/LakeColors.txt
Exported mathematica colormaps. Used for visualization.
前述のファイル内容を見るに、色定義されているようですが、
以下で読み込まれているファイルが存在し、
且つ、適切な状態にセットアップされているのでしょうか？
def _get_wolfram_lake_color() -> np.ndarray:
(......省略......)
file_path = Path("/content/EcohNet_py/external/wolfram/LakeColors.txt")
(......省略......)
■追記
。着色されていない、と何故か思い込んでいましたが、
この状態だとデータがプロットされていない可能性が
頭から抜けておりました、失礼しました。
@uasi さんの回答箇所を確認してみてください。
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@asunasota
Questioner
コメント頂きありがとうございます。セットアップやファイルの有無に関しても確認したいと思います。
はい。確認はしました。
ですが、Readmeにはあまり詳しいことは書いてないですね。
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