自作PCクラスタ構築手順の備忘録
記事の目的 自作PCクラスタの構築手順をしばしば失念するため，その備忘録をここに書き残すこととします． 自作PCクラスタ構築手順 1. 材料の準備 ノード/ファイルサーバ1台ごとに必要なもの C...
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Fortranでユーザー定義演算子.in.を作る
Objective and Motivation ある整数/浮動小数点数/文字列が何らかの集合の要素であるかを調べたいときがよくありますよね． そのときに，if文を使って my_value_is...
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LOBPCG法の実装
Objective and Motivation 構造力学の数値解析として，モード解析またはモーダル解析と呼ばれる手法があります．これは，半離散化された運動方程式 $$ M \frac{\par...
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Fortran＋FastAPIで数値解析webAPIを生やす
Fortran＋FastAPIで数値解析webAPIを生やす Fortranユーザの方々は主に科学技術計算を行うアプリケーションを実装されているかと思います． アプリケーションをブラウザ/API...
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Fortranで関数を引数にとる方法
Fortranで関数を引数にとる方法についての備忘録です． Fortranで数値解析のコードを書いているとき，引数に関数をとりたいときってありますよね． たとえば，関数$f(x)$のある点におけ...
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ユーザー定義派生型の使い方失敗談とその対策
執筆者が体験したユーザー定義派生型の使い方失敗5例 @soybean です． ライブラリplantFEMをメンテする上で，様々な失敗を重ねてきましたので，その例と（当面の）対策について書きます．...
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OpenMPを使って昨日のスペクトル法のコードを高速化してみた by Fortran
はじめに こちらの記事の続きです． 逆離散フーリエ変換のループが重い問題 スペクトル法により一次線形移流方程式を実装する場合，以下のような解法をとることとなります． (1) 初期値を離散フーリ...
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スペクトル法により一次元線形移流方程式を実装してみた by Fortran
はじめに ずっと有限要素法を使って構造計算をやってきた@soy_botです． 最近，時系列解析をする仕事が多く，道具としてフーリエ解析，複素解析を使うことがあります． 特に，高速フーリエ変換(F...
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plantFEMとImageJで葉っぱの3D有限要素メッシュを作る．
今道端で見かけた植物の葉っぱでシミュレーションやりたいそこのあなたへ！ plantFEMでは，こんな葉っぱのメッシュをすぐに作れます． さらに増やせます！ やりかた 環境：Ubuntu 20.0...
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plantFEMで1次元定常拡散方程式ソルバーを自作して動かす。
plantFEMは、植物のFEM解析に特化したライブラリです。 主に3次元拡散、3次元非線形弾性変形、およびそれらのカップリング計算に対する解析を行えます。 追記：拡散係数マトリクスに誤りがあり...
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Fortranで各種疑似乱数を生成
Fortranで各種疑似乱数を簡単に生成できるようにしました。 数ヶ月運用していて、地味に使いやすいので重宝しています。 ソースコードはこちらになります。 https://github.com/...
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Fortranのallocatableがわかりにくいと言われたので対応してみました。
学生さんに、「FortranのAllocatableってよくわからない」と言われた ので、Allocatableを書かずに行列計算できるようにしてみました。 また始めたばかりですのでおいおい追記...
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Fortranの拡張をいろいろ盛り込んだオレオレIO
更新ログ:2021/05/01 ご指摘いただいた事項を修正しました！ ありがとうございました。 Frotranを拡張していろいろ盛り込んだIOを作りました。 ↓こちらのsrc/IOClass/I...
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plantFEMをWindowsで使う方法
数値計算ライブラリplantFEMをWindows10で使う方法 1. Windowsの機能の有効または無効 ＞ Linux for Windowsの有効 こちらのリンクをご確認ください。 また...
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CUDAでBiCGSTAB法を実装した。
CUDAの勉強のため、BiCGSTAB法を実装しました。 有限滑り接触計算やその他のFEM解析でBiCGSTAB法による求解を行うことが多く、GPUで高速化したいなというのがモチベーションです。...
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plantFEMでMPIとOpenMPを一緒に使えるようになりました。
2020.10.24アップデートから、MPIとOpenMPを一緒に使えるようになりました。 端的には、以下のコードが動きます。 program doTest ! OpenMPの使用を宣言 !$u...
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plantFEMで作ったメッシュオブジェクトをmatplotlibで描画する。
plantFEMで以下のようなスクリプトを実行すると、円筒型のメッシュオブジェクトが作られます。 ! server.f90 program main use plantFEM implicit ...
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raid6でデバイスを1個追加してパーティションの拡張を忘れてrebootしたら事故った（解決）
前回↓ https://qiita.com/soybean/items/4ae0da04ae80bda1b0b9 前回raid6で7枚のSSDで組んだが、手狭になったので1台追加した。 前回と同...
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plantFEMでサーバーを立てて動かしてみる。
plantFEMでは、node.js風（あくまで、風です）に簡単にサーバーを立てることができます。 今回は、plantFEMで簡単なサーバーを立てて動かしてみます。 環境はUbuntu 18.0...
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plantFEM(旧SiCroF)におけるファイルIO
plantFEM(旧SiCroF)メンテナをしております。 plantFEMは、Fortranベースのアプリケーションで、Fortranを独自拡張したモジュールを多数用意しております。 まずは、...
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