Crystal の not_nil! の実装がかっこよかった話
はじめに Crystalでコードを書く際には、オブジェクトが nilable かどうかに強い関心を払う必要があります。そんなときに、手っ取り早く nilable ではないということを示すために使...
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Macで選択した文字を右クリックでVOICEVOX（ずんだもん）に読み上げさせる - Automatorを使う方法 -
はじめに VOICEVOXは、ずんだもん動画を作るための不真面目なツールとして有名ですが、個人的にはとても実用性の高い日本語読み上げツールだと思っています。 選択した文字列を読み上げさせたい さ...
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CrystalのASTビューアをWASMでブラウザ上に実装した話
忘れる前にメモしておく。 WASMでブラウザ上で動くCrystalのASTビューアを作った。 後述の笹田さんのプロジェクトを参考に OpenAI の Codex-5.2 とかを主力にして作らせた...
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Crystalのバージョン管理はmiseでできる
概要 mise というツールを使ったところ、異なるバージョンのCrystalをインストールして使うことができて便利でしたので紹介します。 使い方 miseのインストール 公式サイトにプラットフォ...
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Crystal 1.0 リリース 5周年 AMA レポートの要約
以下の記事はAIを使って動画を元に生成された記事となります。 元動画はクリエイティブ・コモンズ著作権表示必須ライセンスです。 Crystal 1.0 リリース 5周年 AMA レポート 元動画：...
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Jupyter Notebookのコーディング - 思考ユニットとしての人間
はじめに Jupyter Notebookを使い始めて感じるもやもやと、現時点での想定解決策について記録します。初心者の感想は数ヶ月後、数年後には、習慣的な解決策を見つけて、あとからはわからなく...
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htslib の改訂から見る次世代シーケンス技術動向
はじめに この記事は、HTSlibのリリースノートを Claude や Gemini に入力して得られた複数の出力を基に、人間の kojix2 が全文を目を通し、再構成することで作成されています...
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wgsimのコードを眺める
はじめに お正月なので、Heng Liさんのコードでも眺めてみようと思って、wgsim というツールのコードを眺めています。このツールはリファレンス配列を与えると、ショートリードシーケンサーのシ...
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Crystal / LLVM 初心者向け 逆引きチートシート
はじめに 目的 この記事は、Crystalのコンパイラの遅さを歯がゆく思っているkojix2がCrystalとLLVMまわりを自分でもっと観察したいと考えて、初心者向けのチートシートとして作成し...
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Crystalのコマンドラインツールの作りかた
はじめに アドベントカレンダー2023の記事です。私はCrsytal言語を主に自分用の小さなコマンドラインツールを作るのに使っています。今日は、コマンドラインツールの作成方法についてまとめます。...
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Crystalのコンパイルはなぜ遅いのか？
本記事の最初のバージョンは2024年8月に書かれました。 2025年12月に内容が不正確であった部分を全面的に書き直して再投稿しました。 はじめに Crystal言語はコンパイルがとても遅いこと...
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CrystalとAIでメモアプリ作ったら面倒だった話
はじめに そういえば、WebViewの練習で作ったメモアプリについてまだ記事にしてなかったなと思ったのでメモします。 GitHub: https://github.com/kojix2/memo...
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だれがCrystalを使っているのか？
だれがCrystalを使っているのか Crystalをやってると、こんなことを思います。 「このプログラミング言語はどこで使われているんだろ?」 私は趣味でCrystalを使っています。ネット上...
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maftools非公式翻訳ドキュメント : MAFファイルの要約、解析、可視化
このページは、maftools の Vignettes maftools.Rmd を Google Gemini を使って日本語に翻訳した非公式ドキュメントです。maftoolsはMITで公開さ...
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GDC MAFファイル形式について
はじめに MAFファイルフォーマットは、がんゲノム研究において体細胞変異データを扱うための標準フォーマットの一つです。実体はタブ区切りテキストファイルですが、34個の必須カラムが指定されています...
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Crystal における並列実行の現在地：ExecutionContext まとめ（2025年）
本記事は人間であるkojix2が、DeepWikiとChatGPTに交互に呼び出して作成した内容をベースにしていますが、人間であるkojix2が全文に目を通した上で編集や校正を行っています。（内...
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SAM/BAMを縦に見るーHTSlib Pileup について
はじめに HTSLIbとは、SAM/BAM/CRAM/VCF/BCF などを操作するC言語のライブラリです。 Samtools や Bcftools など多くのツールでライブラリとして利用されて...
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Fiji で LeicaのLIF形式の画像ファイルを開く（macOS）
LIF は Leica Image File の略で、複数の画像を1つのファイルに保存できるファイル形式である。主にLeica Microsystems社製の共焦点レーザー顕微鏡や蛍光顕微鏡で撮...
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【hts-spec】SAMtags【日本語訳】
Sequence Alignment/Map オプショナルフィールド仕様（日本語訳） GitHub Copilot を用いた非公式日本語訳です。正確性は原文を優先してください。 原文（最新版）の...
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bcftools のプラグインの作り方について、mrubyをまじえて
はじめに Samtoolsと、Bcftoolsは、いずれもHTSLibの上に構築されたコマンドラインツールである。実は、Bcftoolsにはプラグイン機構がある。（Samtoolsにはプラグイン...
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