DNA解析2 - 配列取得 memo
フロー Short Read Array配列取得 ⇨ Qualityチェック ⇨ トリミング SRA 検索 NCBI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov SRA ->...
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DNA解析1 - インストール memo
個人的なメモ。 参考例 NBDCハンズオン講習会: https://biosciencedbc.jp/human/human-resources/workshop/h27 インストール 各種ツー...
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Atom: Pythonスクリプトをシェルにコピペ時の、IndentationError対応メモ
対応 (1) Atom -> Preferences... -> Install -> whitespaceを検索 -> Settingsをクリック。 (2) Ignor...
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R - 個人メモ
統計ソフトRを試用開始。 たった1行で、複数列間の散布図を瞬時に描ける点に、Excelとの違いを実感。 グラフ - 散布図 > data(iris) > plot(iris[, 1:...
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DNA解析3 - マッピング memo
フロー リファレンスGenome配列取得 ⇨ Short Read Array配列取得 ⇨ Qualityチェック ⇨ マッピング ⇨ 可視化 マッピング インデックス作成 Genome配列情報...
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Keras勉強メモ: CIFAR-10画像認識での、ネットワーク構造依存を確認してみた
MNIST手書き文字の次に、いわゆる画像、の認識にトライしよう、とCIFAR-10に。 CIFAR-10は、飛行機からトラックまでの、たった10カテゴリーの分類課題。ピクセル数も32x32とコン...
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初級者が、TensorBoardで、MNISTのEmbedding Visualizationを表示 (ぐるぐる動かして見る)
多次元空間ベクトルを、3次元に射影してグルグルと自由自在に表示できそうな、TensorBoardのEmbedding Visualization、にトライしました。TensorFlowはインスト...
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Keras初級者メモ: Dropoutの効果をちょっと確認 (MNIST)
Kerasをインストールしたので、Dropoutの効果を確認してみました。 学習繰り返し数による、認識率の推移を、プロット。 Dropout無し → 学習用データ自身の認識率は100%に達してい...
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