pythonでテスト駆動開発をしながらAtcoderを解くABC071
今日の目標 前回テストの大切さを知ったので、テスト駆動開発で競技プログラミングを解くことを試してみる 事前に考えたこと 競技プログラミングはそんなに処理が多くないから無駄じゃない？ →自分はその...
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n次の連立方程式などABC133
概要 ABC133をA~Dまで、pythonでの正解例を見ながら解いていった。 目標 まずは自分でどういう方針で行けばいいのかを考えてから、コードを読む（こういうことをしたいけど、どう描くんだろ...
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biocondaからの環境構築[備忘録]
イントロ bio系のツールは多くがgithubなどでOSSとして配布されていますが、依存するライブラリが多かったり、環境が違ったり、ツールによって依存するライブラリのバージョンが違ったりして環境...
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python でKMPの前処理テーブルを書く[備忘録]
イントロ 競プロの問題でKMPを書いたので備忘録 今まで書いたことがなかった割にはアルゴリズムは単純で、一方で少し混乱するところもあったのでそこに関しても記述する KMPalgorithmとは ...
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pythonのみで２次元配列の転置、型変換を行う方法[備忘録]
やりたいこと pythonの二次元配列を転置してさらにint をstrに変換する pandas やnd.array は使わないで行いたい example.txt [ [5, 0, 1, 1], ...
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VScode で一括置換 大文字小文字を区別[備忘録]
やりたいこと VSCode上での現在開いているファイル内で一括置換を行う 大文字と小文字を区別する 方法 VScodeのメニューバーから [Edit] => [Replace in Fi...
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metagenome シークエンスから高速に各readの系統を推定するKraken2[環境構築]
Krakenとは k-merを用いて多数の配列に対してそれぞれの配列の系統を高速に推定するtoolです。 2019年の末に後続のKraken2の論文がｐublish されました Kraken2と...
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array job を送る時に詰まったこと[並列計算][備忘録 ]
概要 スパコン使用時にqsub でarray job を使うときのメモです アレイジョブとは？ qsub の一種でパラメータが異なる同一の処理のジョブを多数実行する時に複数のjobを１つのファイ...
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スパコンでguppy をGPUモードで動かす[Sirokane](備忘録）
この記事は何？ 大学のスパコン(Sirokane) で初めてguppy をGPUモードで動かす際につまったので備忘録的なメモ 解決したコード run_guppy_GPU.sh # !/bin/s...
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スパコン上でconda の仮想環境をactivateする際にCommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.時のメモ
状況 スパコン上でqiime2というbioinfoのソフトウェアを動かすためにqiime2用のcondaの仮想環境作ってそこに入ろうとすると 以下のようにCommandNotFoundError...
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rsync でディレクトリごとコピーする際に気をつけること~ディレクトリの中身をぶちまけないために
結論 NG1.sh rsync -r from_dir/from_file/ to_dir/ 元ディレクトリのパスにケツスラッシュをつけると、from_dir はコピーされず、from_dir以...
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Pandas : 条件を満たす行を抽出時のエラー ValueError: The truth value of a Series is ambiguous. Use a.empty, a.bool(), a.item(), a.any() or a.all(). の原因と対策
結論 ValueError: The truth value of a Series is ambiguous. Use a.empty, a.bool(), a.item(), a.any()...
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pythonでdictを使う時のメモ[競プロ]
計算量がO(1)という嘘んくささ（一応理由は理解しているつもりですが）に拒否感があり、今まで頑なにdictを使ってきていなかったのですが、先週参加したFHCでdictを使うと楽な問題が出たので...
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競プロ初心者こそ環境構築しよう(codeforces編)[cftoolsの使い方]
イントロ 以前書いていたatcoder向けの環境構築の記事が僕の記事の中では人気でありがたいことに今でもポツポツLGTMなどをもらっています。 twitterなどを見ていてもatcoderの...
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atcoder初心者こそ環境構築しよう！(atcoder-cli,online-judge-toolsのインストール、使い方）
きっかけ @anchor-cable さんの記事で紹介されていたのをみて、初心者こそ、環境構築が必要！って思った（実際にそう主張されてた） 今回使うツールのgithub リンク star送りまし...
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[bash] コマンド履歴を一気にコピペする方法
history で見るとコマンドの番号が入ってそのままではコピペに使えなくてめんどくさい。 調べたら簡単なコマンドでできたのでメモ https://qiita.com/catfist/items...
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.bashrc,.bashprofileの変更反映
.bashrcなどを変更したときにすぐに反映される方法 一回ターミナルを閉じ直して、もう一度開き直せば反映されますが、コマンドからやるときは $source ~/.bash_profile でO...
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vim でcopy and pastする[備忘録][vim]
dd -> p ぐらいしか使ってなかったが、１行単位ではなく、もっと細かくコピーしたい そのためにvimでの色々な削除の仕方を調べたのでメモ。 参考 https://qiita.com/F...
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Mac で圧縮ファイル を解凍する[gzip -d,unzip,tar xzfv,tar xjfv]
いつもgzip,unzip などがわからなくてググるのでメモ https://dekirukigasuru.com/blog/2017/05/27/archiver/ を参考 .gzの解凍 un...
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ABC135のメモ
クソ記事でもいいから取り合えずたくさん書いて後から修正しようキャンペーンの第２弾なので質は。。です。 以前書いて、下書きに残っていたものをそのまま投稿しています。（なので古いです） 結果 a,b...
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