anacondaにある同一名のもの

###教えていただきたいこと
anacondaにはダウンロードしたてでも同じファイルが複数入っているのですが、問題ないのでしょうか？
例えば、navgator。パスを見ると、pkgsフォルダーに他のフォルダーがあり、さらにそこにもう一つのanaconda-navigatorが入っている模様。
片方を消すと異常が出るのでしょうか？