Mac M1でのRベンチマーク
Macbook pro m1maxを入手したのでいくつかの方法でRのベンチマークを試してみました。 ① mac上にインストールしたR 4.1.2（ローカルで走らせているので最適化されているはず）...
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code-serverをGoogle Colaboratory上で起動する
前回はRstudio-serverをColab上で立ち上げたのですが今回はcode-serverを立ててみました。 Google Colaboratoryは無償で使用可能なクラウドのNote...
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Google ColaboratoryをベースにRstudio serverを立ち上げる。
R Advent Calendar 2020 3日目の記事になります。 Google Colaboratoryは無償で使用可能なクラウドのNotebook環境ですが、Pythonでの使用が主です...
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Rmarkdownからknitする際\newcommandを使えるようにする
r-wakalangでatusyさんに教えていただいたのでこちらにまとめます。 Rmarkdownで論文を書いている際、こちらのように数式内に下付きの$argmax$を使いたかったのですが、なか...
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Rからgoogle driveのデータにアクセスする
[本記事の内容は最新版のGoogle drive api v3 (2019年１１月時点)には対応していません。] Rにgoogledriveというパッケージがあります。 これを使えば、ローカル（...
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Rstudio Cloudでtmapをインストールする
表題の件、できなくて困ってて放置していたのですが、twitterで@uriさんが解決案を提示してくれました。これでtmapがRstudio cloudで利用できます！(2018年12月の話です)...
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Rでdropboxのデータをインポート
RでDropboxのデータリンクからデータを読み込みたいとき。 参照：https://stackoverflow.com/questions/31955995/how-to-download-f...
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texテンプレートを使ってknitrからpdfを作る際のエラー対処
学術雑誌や学会論文など、latexのテンプレートを配布しているところが多いが、それらを使ってRmarkdownからpdfを作成したい。今回は小さなエラーが出てつまづいたので、おそらくすぐ忘れるの...
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[R]st_readで日本語のshpを読み込むときの設定
忘れるのでメモ。 日本語を含むshpファイルをsfパッケージで読み込むと文字化けするので ENCODINGのオプションをつける shp <- sf::st_read("import.shp...
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複数のGeotiffを１枚にマージして、かつ１バンドのみを取り出す
こちらではgdal_merge.pyをつかって分割されたGeotiffをマージしました。 今回ここでやりたいことは、分割されているそれぞれのGeotiffに複数のバンドが格納されており、またそれ...
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複数のGeotiffを１枚にマージする（gdal_merge.py)
自分用メモ。 参考：ここ、公式マニュアル バーチャルラスターをつくるのが望ましいもののどうしても一枚の画像にマージしたいときもある。 gdal_merge.py -o OUTPUT.tif -o...
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rmarkdownをknitする際にpdfでもdocxでもテーブルをきれいに出力する
参考：ここ Rstudioでknit to pdf またはknit to wordのボタンを使う際に有効。 library(knitr) library(kableExtra) library(...
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rmarkdownからdocxファイルをknitする際にテーブルをきれいに生成する
Rmarkdownで書類を作成する際に一番困るのがdocxファイルに変換するとき。すべてpdfで扱えれば一番いいのだが、どうしてもワードが必要なときにしょっちゅう出くわす。rmarkdownでk...
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spplotのタイトルの字体を変更する
rでspplotをもちいて地図を描写する際タイトルの字体を変更する必要があったのでメモ。 Rstudio Cloudはこちら テストデータをダウンロード＆デフォルトで描写 library(sp)...
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knitr to PDFでの複雑なテーブル（書体を変更する）
Rstudio Cloudのリンクはこちらです。 rmakrdownとkableを使ってテーブルをかいてたところ、複雑なテーブルを書く際にkableExtraというパッケージがとても有用だという...
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knitr to PDFでの複雑なテーブル（行グループのタイトルを追加する）
Rstudio Cloudのリンクはこちらです。 rmakrdownとkableを使ってテーブルをかいてたところ、複雑なテーブルを書く際にkableExtraというパッケージがとても有用だという...
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colaboratory でshpファイルを読み込んで描画してみる
pythonの勉強がてらshpファイルをcolaboratory上で読み込んでプロットしてみた。
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rworldmapで入手可能なNatural Earth dataの全球国別ポリゴンデータをGEEで使う
Google Earth Engine内のカタログをみてみてもみあたらなかったので、仕方なくローカルからポリゴンデータをアップロードしました。 やったこと ただ、Rからrworldmapを読み込...
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GEEのオリジナル背景を作成する
GEEデフォルトではGoogle Mapsの画面が背景になりますが、 任意で作成することが可能です。 例えばこんな感じ。標高を強調しています。 var elv = ee.Image('NOAA/...
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