GPSデータをUTM変換してポイント間の距離を計算する
gDistance 以下のようなデータを使う。 UTM 座標に変換した後、rgeos パッケージの gDistance 関数で計算する。 gDistance library(rgeos) lib...
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adehabitatLT で動物の移動軌跡を分析＆時系列 GPS データを間引く
動物の移動軌跡を分析するパッケージとして adehabitatLT がある。 今回の目標は ・GPS データを ltraj 形式に変換する ・移動軌跡にかんする情報を得る ・GPS データを間引...
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最外郭法（MCP）で行動圏を推定＆重複割合を計算
最外郭法（Minimum Convex Polygon: MCP）で個体ごとの行動圏を推定し、 それぞれの個体ペアでどれくらい行動圏が重複するかを計算する。 カーネル推定の場合は adehabi...
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adehabitatHRのkernelUD関数のパラメータを検討する
adehabitatHR パッケージ内の kernelUD ではさまざまなパラメータを設定してカーネル推定できる。 どのように指定すればいいのか迷うのでその一部にかんするメモを作成した。 基本的...
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adehabitatHRで行動圏の重複を計算する
結論 同じ個体の行動圏利用の変化を調べるなら Bhattacharyya’s affinity (BA)、 個体間の行動圏重複を調べるなら Utilization distribution ov...
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adehabitatとadehabitatHRで行動圏推定
結論 おすすめされるままにadehabitatHRを使おう（ライトユーザーの意見 まずadehabitat 行動圏を推定するのに以前は adehabitat パッケージを使っていた。 たとえば以...
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