10分でできる BDD チュートリアル in Rust
このチュートリアルでは BDD フレームワーク Cucumber の Ruby 版チュートリアル「Is it Friday yet?」をもとに，Rust で同様のテストを再現します． このチュー...
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Bio.Phyloの使い方
研究会での論文読みにてTalevich, Eric, et al. "Bio. Phylo: a unified toolkit for processing, analyzing and vi...
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PineappleのPython環境をpyenvで変更できるようにしたメモ
IPythonのMac用フロントエンドアプリPineappleの最新バージョンPineapple-0.8.0(Python 3.5, Full version)(2017年3月17日現在)をPi...
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3分くらいでできるゲノム解析
はじめに ※ この記事の内容は決して学術的なものではなく，ぼくの浅学さによる誤解があるかもしれません． こんにちは．メディアアートコースメンターのハルくんです． ぼくは大学で情報科学と生命科学を...
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Bio.Phyloのdraw_ascii関数で描いた系統樹をテキスト形式で保存する
Biopython のdraw_ascii関数で得られる系統樹が戻り値ではなく標準出力だったのでそれをテキスト形式で保存する方法についてメモ． from Bio import Phylo imp...
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Biopyton からClustalW2を使って系統樹を作成する
Biopyton からClustalW2を使って系統樹を作成する方法について自分用にメモ． といっても内容はほとんどBiopython Tutorial and Cookbookに書かれているこ...
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