セマンティックセグメンテーションにおける評価指標について

セマンティックセグメンテーションの評価指標は様々あると思いますが、kerasでmetrics=["accuracy"]で得られる精度は信用度は高いのでしょうか？
というのも現在動かしているニューラルネットワークではmetrics=["accuracy"]では精度が高く、自作した評価指標では精度が低くなってしまいます。
もちろん自作のコードが間違っていることもあり得ますが...
自作した評価指標はmIoUを算出しているつもりです。