pydicom, monaiについて知りたい

pydicom については公式のドキュメントが必要十分であるかと思います。
https://pydicom.github.io/pydicom/stable/
もちろんそれ以前に DICOM に関する知識があることが前提です。
https://www.dicomstandard.org/current

アドバイス感謝します。DICOMデータの置き場所がわからなく、同じように記述してもうまくいかなく困っています

pydicom をセットアップして説明にしたがって実行するとサンプルデータも入ります。

https://pydicom.github.io/pydicom/stable/old/getting_started.html
このページの例では

>>> filename = get_testdata_file("rtplan.dcm")

この後で filename と打てば次のようにサンプルデータのパスが表示されます。

>>> filename
'/home/username/.local/lib/python3.X/site-packages/pydicom/data/test_files/rtplan.dcm'

自前のデータがあるのなら filename にそのパスを指定すれば良いでしょう。

python初心者で、jupyterlabを使用しています。ご返事深く感謝しております。test.dcmを、c:\ユーザー\HP\ダウンロード\bennkyou\aipandas
に入れております。下記を実行しましたが、何も出てきません。お教え願えれば幸いです。
import pydicom as dicom
ーー
from PIL import Image
import numpy as np
ーー
filename = get_testdata_file("test.dcm")
filename

get_testdata_file() はあくまでも pydicom で用意されているテストデータを取得して、そのパスを返すメソッドですから、自前のファイルを参照するなら下記のようにすれば良いです。

ds = pydicom.dcmread('path_to_myfile') 

メソッドの説明は help() で得られます。

ありがとうございました。実行したところ下記となってしまいます。
import pydicom

import os

path = os.getcwd()

print(path)
C:\Users\HP\Downloads\Untitled Folder\aipandas

ds = pydicom.dcmread('test.dcm')
print(ds)

Error　message

FileNotFoundError Traceback (most recent call last)
Cell In[31], line 1
----> 1 ds = pydicom.dcmread('test.dcm')
2 print(ds)

File ~\anaconda3\Lib\site-packages\pydicom\filereader.py:1002, in dcmread(fp, defer_size, stop_before_pixels, force, specific_tags)
1000 caller_owns_file = False
1001 logger.debug("Reading file '{0}'".format(fp))
-> 1002 fp = open(fp, 'rb')
1003 elif fp is None or not hasattr(fp, "read") or not hasattr(fp, "seek"):
1004 raise TypeError("dcmread: Expected a file path or a file-like, "
1005 "but got " + type(fp).name)

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'test.dcm'

可能でしたら、お願いします。

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'test.dcm'

このメッセージの通り、カレントディレクトリに test.dcm ファイルが無いのでしょう。

python の基本的なチュートリアル等を熟されてから pydicom に進まれるのが結果的に早道になるかと思います。

@mizu4myさま
アドバイスほんとうに感謝しております。
【DICOM】【入門】Pydicomの使い方###
を読み、いろいろ試しております。
解決方法を教えて下さい。
下記コードをいれ、何とか、dicomデータを読めました。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
import pydicom
import cv2

file = pydicom.dcmread('test.dcm')
print(file)
上記で、読めることは確認できました。下記を走らすとエラーが出ます。
file = pydicom.dcmread('test.dcm')
img = file.pixel_array
plt.imshow(img)
plt.show()

発生している問題・エラー

出ているエラーメッセージを入力

RuntimeError Traceback (most recent call last)
Cell In[106], line 2
1 file = pydicom.dcmread('test.dcm')
----> 2 img = file.pixel_array
3 plt.imshow(img)
4 plt.show()

File ~\anaconda3\Lib\site-packages\pydicom\dataset.py:1955, in Dataset.pixel_array(self)
1940 @property
1941 def pixel_array(self) -> "numpy.ndarray":
1942 """Return the pixel data as a :class:numpy.ndarray.
1943
1944 .. versionchanged:: 1.4
(...)
1953 :class:numpy.ndarray.
1954 """
-> 1955 self.convert_pixel_data()
1956 return cast("numpy.ndarray", self._pixel_array)

File ~\anaconda3\Lib\site-packages\pydicom\dataset.py:1512, in Dataset.convert_pixel_data(self, handler_name)
1510 self._convert_pixel_data_using_handler(handler_name)
1511 else:
-> 1512 self._convert_pixel_data_without_handler()

File ~\anaconda3\Lib\site-packages\pydicom\dataset.py:1599, in Dataset._convert_pixel_data_without_handler(self)
1593 names = [hh_deps[name][1] for name in missing]
1594 pkg_msg.append(
1595 f"{hh.HANDLER_NAME} "
1596 f"(req. {', '.join(names)})"
1597 )
-> 1599 raise RuntimeError(msg + ', '.join(pkg_msg))
1601 last_exception = None
1602 for handler in available_handlers:

RuntimeError: The following handlers are available to decode the pixel data however they are missing required dependencies: GDCM (req. ), pylibjpeg (req. )```

上記のエラーが出ており、解決ができません。大変申し訳ありませんが、アドバイスいただけたら幸いです。
村井　茂

件のファイルは圧縮データではありませんか。メッセージにある通り、画素データをハンドリングするためライブラリ(GDCM, pylibjpeg)が不足しているようです。

RuntimeError: The following handlers are available to decode the pixel data however they are missing required dependencies: GDCM (req. ), pylibjpeg (req. )

エラーメッセージを読んで理解するのはプログラミングの基本です。特に難しいことは書いてありません。

pydicom は圧縮データの扱いにまだ難がありますし、まずは非圧縮データから始めるのが妥当です。DCMTK の dcmdjpeg などで変換できます。

前に書いた通りチュートリアルや例題の理解から始めましょう。