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ChemTHEATREでPython学習

ChemTHEATRE_YOKO_color.jpg

ChemTHEATREとは

ChemTHEATRE (chem-theatre.com)とは,生物・非生物を問わない環境媒体中の化学物質濃度を,環境媒体に関するメタデータとともに収録したデータベースです。データソースは学術論文をはじめ,国や公的機関による調査結果も含みます。
詳細はChemTHEATREのウィキサイトまで。

Pythonでモニタリングデータの解析&可視化をやってみる

ChemTHEATREに登録された実際のモニタリングデータを使ったデータ解析や可視化について,初心者向けに説明しています。

内容 掲載年月日
Part1 基本統計量,箱ひげ図 2020/04/13
Part2 点推定,区間推定,信頼区間,推定結果の可視化 2020/04/23
Part3 主成分分析 2020/04/24
Part4 自己相関,時系列予測
Part5-1 データの地図上へのプロット 2020/05/11
Part5-2 データの地図上へのプロット
Part6 仮説検定,2標本t検定,無相関検定
番外 有機フッ素化合物のデータをQGISで地図上にプロットする 2020/06/19

テキストは順次アップしていきます。

ChemTHEATREからのデータのエクスポート

上記のデータ解析をするにあたり,ChemTHEATREで必要なデータを検索し,テキストファイルとしてエクスポートします。

sample_search.png

  1. ChemTHEATREのメニューバーから「Sample Search」を選択する。
  2. 試料に関する情報(生物・非生物,化学物質,採取地点,採取年月日,フリーワード)で絞り込む。
  3. 「Search」ボタンをクリックすると,条件に合致する試料の一覧が出力される。
  4. 「Export samples」で試料の情報が,「Export measured data」で目的の化学物質の測定値が,タブ区切りのテキストファイルとして出力する。

エクスポートしたファイルを任意のディレクトリに保存して,解析に使用してください。

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