RDS無料枠について

Estimated Monthly costsの内訳が分からないので推測で回答しますがご了承ください。

まずはあくまでEstimated（推定）なので実際の支払額とは異なります。無料枠関係ないのでやや分かりづらいですね。

次に21ドルの内訳ですが、提示いただいたリンク先に
無料利用枠には、Amazon Aurora、Microsoft SQL Server 用 Amazon RDS、または Oracle データベースエンジンで起動された RDS DB インスタンスは含まれません。
と記載されていることと、
こちら（↓）の質問でも大体同じ値段が表示されているのでそういうことだと思います。
https://qiita.com/TaikiTkwkbysh/questions/f22d3fce941eeb03089d

解決方法ですが、Billing and Cost Managementで利用額が無料枠を超えそうになったらメールで通知するアラートを設定するのはどうでしょうか。