github のリポジトリのファイルの一部を非公開にしたい

解決したいこと

WEBサイトを開発しています。
githubにコードを公開したいのですが、一部のファイルは非公開にしたいです。

発生している問題・エラー

外部サービスを使っており html ファイルにサービスのキーを入力していますが、キーの部分は公開できません。

githubのリポジトリを二つ作って開発用はprivateに、公開用はキーを書かずに不完全にすれば可能かもしれませんが、他にいい方法はありませんか？