いくつか方法があります。

1 ModelerScriptによる方法

Scriptは必要ですが、汎用的な方法になります。

ブログで学ぶSPSS_Modeler #01- 予測モデル安定化のためのN分割交差検証をPythonスクリプトでチャレンジ | IBM ソリューション ブログ

2 C5.0のオプション

C5.0ではオプションで指定が可能です。
C5.0の「ブースティング」と「交差検証」について

3 自動モデリングノードのオプション

V18.2.2から自動モデリングノードのオプションで可能になりました。
SPSS Modelerでクロスバリデーションをする - Qiita