aenetとASEを用いてANNポテンシャルによるMDシミュレーションをやってみる
aenet (Atomic Energy Network) はANN (人工ニューラルネットワーク) 原子間相互作用ポテンシャルを扱うためのパッケージです．DFT計算をもとに新規ANNポテンシャ...
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ASEとGPAWでDFT計算を行う
ASEとGPAWを用いてDFT計算を行ってみます．簡単な例として水素分子の原子化エネルギーを求めましょう． ASEは原子シミュレーション用のPythonモジュールです．多くの機能が実装されていま...
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ASEのMDモジュールで遊ぶ
ASE (Atomic Simulation Environment) のase.mdモジュールを用いて，Ni結晶のMDシミュレーションをしてみます． モデル Ni (fcc) のバルクモデルを...
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Minima Hopping法を用いて吸着構造を探索する
ASE (Atomic Simulation Environment) に実装されているMinima Hopping法を用いて，Pt表面上でのH2分子の吸着構造を探索してみます．この記事は公式ド...
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遺伝的アルゴリズムを用いて金属ナノクラスターの安定構造を探索する
ASE (Atomic Simulation Environment) には遺伝的アルゴリズム (GA) を用いた安定構造探索の機能が実装されています． 遺伝的アルゴリズムを用いると，バルクやナ...
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