RでSMILESをCAS番号から効率よく入手する方法(ケモインフォマティックの小技):webchemパッケージ
はじめに ケモインフォマティックの分野では、有機化合物のSMILES表記がよく用いられており、分子の構造などを数値化した分子記述子や、分子の部分構造などの有無を0/1のビットで表記したフィンガー...
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はじめに ケモインフォマティックの分野では、有機化合物のSMILES表記がよく用いられており、分子の構造などを数値化した分子記述子や、分子の部分構造などの有無を0/1のビットで表記したフィンガー...
Qiitaの駿台予備校の広告の「あれ」の記事がありましたので、Rでも台無しにしてみました。 動作環境 R 4.1.2 RStudio 2021.09.1 Build 372 使用パッケージ 今回...
この記事のモチベーション RStudioでRをメインに使用しているが、やりたいことがPythonでシンプルに可能である場合に、RとPythonのいいとこ取りをしたい。 Pythonで作成したデー...
背景 AppleのCPUであるM1を搭載したMacbook AirでRStudioのスクリプトを使用したところ、以前のIntel CPUのMacbook Airで動いていたRのパッケージの一部が...
はじめに 多くの統計モデルは正規分布(ガウス分布)を想定しており、繰り返しの観測などで得られたデータが正規分布であるかどうかを確認することが必要であると言えます。 そのような確認をするツールとし...
はじめに Wordcloudを仕事で使用していたのですが、古いmac (Intel mac) が壊れてしまい、M1 macに入れ替わったあとRMeCabが全く使えず、使えるようになるまで結構苦労...
#はじめに 機械学習の参考書をみていたら、wordcloudの例が紹介されていて、Perfumeの歌詞をwordcloudで可視化したいという衝動に駆られてしまいました。 数時間、試行錯誤をした...
1.動機 この記事はメモやメールなどの文章入力時にその時の日時(例:20210124Sun_1802)を入力する機能について記述します。 議事録や自分の日記などの日時を入力する際に、アプリのタイ...
やりたいこと MacのTeXShopで図の多い文章を作成する際に、以下の2つを解決してPDFの形で出力したい。 Microsoft Wordの感覚で図や表を その場所 に配置できない(LaTeX...
動機 MS WordやPowerpointの数式エディタの改悪によってシグマの表示がインラインモードしか作成されなくなってしまい、TeXで作成する必要性に迫られて今回macで使用環境を整えました...
はじめに Rでcsvを読み込むスクリプトを走らせていたのですが、以前問題なく動いていたスクリプトが、最近作成したcsvファイルを読み込んだ時に突然動かなくなり、そのトラブルシュートで2時間以上か...
はじめに 日本地図の県ごとにとある製品の売り上げを視覚化することが必要になり、応急処置的に自分のデータで作成以下の記事を参考にして作成しました。 今後も使うことがあるかと思うので、私の備忘録とし...
背景## 学会の発表資料作成でRでVenn図を書かなければならなかったのですが、調べても自分がやりたい「csvファイルのデータを読み込んでVenn図を書く」という方法について、ドンピシャの情報が...
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