このページではTrinityを動かすために必要なソフトウェアであるSalmonのインストール方法を記載しています。
Salmonとは
事前準備
ホームディレクトリ直下(~/)にsrcとbinを作っておきます。
/src...パッケージ等を解凍したものの置き場所。
/bin...実行ファイル置き場。
のように置き場所を決めておくと便利です。
インストール
今回インストールするものはプリコンバイル版なので、makeなどの特別な作業は必要ありません。
適当な場所にsalmon-0.12.0_linux_x86_64.zipをダウンロードします。
wget https://github.com/COMBINE-lab/salmon/releases/download/v0.12.0/salmon-0.12.0_linux_x86_64.tar.gz
以下のコマンドで解凍します。
tar xvzf salmon-0.12.0_linux_x86_64.tar.gz
解凍したものを~/srcディレクトリに配置します。
mv salmon-0.12.0_linux_x86_64 ~/src/
シンボリックリンクを貼ります。
ln -s $HOME/src/salmon-0.12.0_linux_x86_64/bin/salmon $HOME/bin