pythonによるPDFファイルの読み込みについて

解決したいこと

仕事で、弥生の見積納品請求書　というソフトを使っています。
このソフトにはデータのCSV出力機能がないので、PDF出力したものから、pythonで読み取りCSVを作成しています。
既存のPDF出力ドライバーでは読み取り出来なかったので、CubePDFを使っています。
弥生のソフトを最新版にアップグレードしたところ、CubePDFが今まで通りのPDFを作成しなくなり、データが取れなくなり困っています。
弥生のリリースノートには、
製品の基盤となるしくみを「.NET Framework 3.5」から「.NET Framework 4.8」に変更しました。この変更によって、旧製品と比べて画面表示や印刷結果が異なる場合があります
とありました。

pytnonで読み取りのできるpdfを出力する方法をご存知の方がいらっしゃったら、教えていただきたいです。

自分で試したこと

既存のPDFドライバーで出力したもを、OCR処理して読み込むpythonプログラムも作成してみましたが、OCRの結果にムラがあり、満足のいく結果は得られませんでした。