自作アプリのソースコードを販売することは法律及びライセンス的に問題ないのでしょうか？

具体的なライセンスの提示が一つもないので何をしたいのか不明です。
また、サービス業と製造業、商用利用、再配布を理解されていないように見受けられます。

また、アプリそのものを譲渡（運営、ドメイン、サーバー等も含めて）する場合もソースコードを売却することに変わりはないと思います。

その理屈だとPC販売メーカはWindowsのソースコードを販売しているという謎展開に？

何より力量が不足しているので販売したいと思うならまずはソフトウェアに強い弁護士に相談してください。勝手に判断されるのは非常に危険です。

しかし、自作のアプリと言っても、中身を見れば様々なライブラリを使っていますし

そのライブラリのライセンス規約に従う必要があります。商用利用不可のものもありますし、著作権表示が義務付けられているものもありますのでご注意ください。