Ubuntuで編集したPythonプログラムをWindowsで走らせた際のエラー

こんにちは．閲覧ありがとうございます．

タイトル通り，Ubuntuで編集したPythonプログラムをWindowsで走らせようとした際にエラーがでます．
具体的にはsubprocess.Popenにおいて，「ファイルにアクセスできません」と表示されます．

OSError: [WinError 1920] ファイルにアクセスできません。 

Ubuntu上では，正常に動きます．
外付けのHDDにてデータを移動し，Ubuntuとほぼ同じ環境でプログラムを起動した際に出るエラーです．
いろいろ調べましたが、このエラーが一向に治りません．
プログラムのディレクトリの場所を指定する行は何度も確認し，正しいことを確認しています．
おそらくwindowsの環境に移したことで出るのかとは思いますが，この解決策の案など教えていただけると幸いです．
よろしくお願いします．