画像解析ソフトでプラグインを使いたいです。
解決したいこと
cellposeという画像解析ソフトのプラグインで「exclude on edges」を使いたいです。
細胞の画像解析を自動化するために、下記のページに従い、Anaconda、cellposeのインストールを行い、解析自体は正常にできました。
https://qiita.com/Naka24-sun/items/df672b12e2daa016e8cb
https://qiita.com/Naka24-sun/items/a717d2dc1b3519112fff
しかし、cellposeでは画面端に見切れている細胞を一つと数えて測定してしまうため、測定結果に影響してしまいます(手動でトレースした場合と異なる結果になります)。
調べてみると、それに見合うプラグインのようなものが公開されていますが、これの使用方法が分かりません。
https://github.com/MouseLand/cellpose/issues/249
https://github.com/MouseLand/cellpose/commit/a32afa06976039bd41b17ccb1d94c8a55fc6ce04
Anaconda、cellposeのインストール事態も、コピペでやっただけなので、プログラムに関しては全くの素人です。
上記のURL内のGithubが何なのかも理解していません。
この問題について、素人でも解決できる方法があれば教えていただきたいです。
また、「このWebサイトで勉強すればできるようになる」などもありましたらご紹介願いたいです。
何卒よろしくお願いいたします。
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