【2026年版】bulk RNA-seq 二次解析を公共データで実際に動かして徹底解説（ikra → DESeq2）
トランスクリプトーム解析シリーズの第二弾として、本記事では bulk RNA-seq の二次解析（secondary analysis） を扱います。 対象は、一次解析で得られたカウント行列から...
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【2026年版】scRNA-seq の次元削減を数式から理解する：PCA・t-SNE・UMAP をPBMC3kで実際に動かして比較
scRNA-seq では、1細胞ごとに数千から数万遺伝子の発現量を扱います。つまり、各細胞は「遺伝子数次元のベクトル」として表されます。PBMC3k のような比較的小さなデータでも、解析対象は ...
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【2026年版】bulk RNA-seq解析の一次解析を徹底解説
トランスクリプトーム解析の記事第一弾として、本記事では**bulk RNA-seq 一次解析（primary analysis）**に焦点を当てます。 対象は、FASTQファイルから遺伝子発現カ...
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