Juliaで言語処理100本ノック打ってみた 第4章
第3章はこちらから。 第４章 形態素解析 夏目漱石の小説『吾輩は猫である』の文章（neko.txt）をMeCabを使って形態素解析し，その結果をneko.txt.mecabというファイルに保存...
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Julia で言語処理100本ノック打ってみた 第3章
前回、Juliaで自然言語処理100本ノックを1章だけやりました。今回はその続きです。 ※ 前回記事の最後に「Uniprotデータベースのちょっとした調査を……」と書いていますが、あれは嘘になり...
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Julia でテキスト処理
以前，Julia で FizzBuzz のショートコーディングに挑戦しました。今回は，まっとうに Julia をテキスト処理のために使いたいと思います。そのための練習になります。 環境設定 Ju...
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最短であってほしい Julia の FizzBuzz
科学技術計算で最近流行りの Julia。FizzBuzz で練習しました。使用バージョンは 1.1.0。 普通のやつ (131 byte) for i in 1:100 if i % 3 == ...
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Modeller による Cαモデルを鋳型とした全原子モデルの構築
Cαモデル まず，この記事では下の例に示すようなCαのみのモデルを「Cαモデル」と（勝手に）呼んでいます。 一般的にタンパク質の構造データは，PDBに登録されているなどして，少なくとも主...
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Pymolでトラジェクトリの最初の構造を取り除く方法
はじめに：PymolでのMDトラジェクトリの読み込み これは，銀すみ先生の記事に述べられている通りに実行すれば簡単に行うことができます。しかしながら，最初に読み込んだ構造が残ってしまいます。 P...
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計算機クラスタ等でlinuxbrewが使えないときの対処
linuxbrewについて 既にいくつかの記事にも書かれています通り、linuxbrewは 管理者権限がなくてもパッケージのインストールが可能 ホームディレクトリにインストールができる ディスト...
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