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【R】オフラインPCへのパッケージ導入をアプリで解決する

Last updated at Posted at 2017-11-24

オフラインPCにパッケージを導入するのはすこし面倒

  • 以下の数行が必要
オンラインPCconsole.R
install.packages("miniCRAN")
library(miniCRAN)

# 必要なパッケージをリスト
pkglist <- pkgDep("packagename")

# パッケージを特定のディレクトリにダウンロード
## win ---
download.packages(pkglist, destdir = "path_to_dir", type = "win.binary")

## mac ---
download.packages(pkglist, destdir = "path_to_dir", type = "source")

  • 導入先PCにインストールするために以下のコードも必要
オフラインPCconsole.R

# win
install.packages( c("path_to_downloaded_file/packagename.zip",
                    "path_to_downloaded_file/packagename2.zip",
           "path_to_downloaded_file/packagename3.zip",
                    "path_to_downloaded_file/packagename4.zip",
                    "..."), 
    repos = NULL, conrib.url="win.binary", type = "win.binary")

# mac
install.packages( c("path_to_downloaded_file/packagename.tar.gz",
                    "path_to_downloaded_file/packagename2.tar.gz",
                    "path_to_downloaded_file/packagename3.tar.gz",
                    "path_to_downloaded_file/packagename4.tar.gz",
                    "..."), 
    repos = NULL, type = 'source')
  • すこし面倒

"path_to_downloaded_file/packagename...."の箇所が特に面倒だなと個人的に思ってました。
(ダウンロードした時のコンソールから矩形で該当部分切り取るなど)

アプリで自動化

image.png

入力:必要なパッケージ, パッケージをダウンロードするフォルダへのpath
出力:オフラインPCでのインストールに必要なコード

 使い方

0.アプリの依存パッケージを導入

オンラインPCconsole.R
dynamic_require <- function(package){
  if(eval(parse(text=paste("require(",package,")"))))return(TRUE)

  install.packages(package)
  return(eval(parse(text=paste("require(",package,")"))))
}

dynamic_require(c("dplyr","shiny","rintrojs","miniCRAN","shinymaterial"))

1.アプリを起動 (Open in Browser推奨)

image.png

1.1 ガイドをクリック

image.png
rintrojsがイントロダクションしてくれます↓
image.png

2.パッケージを入力 (ダブルクォート、スペースなし)

image.png

3.オフラインPCのOSを選択

image.png

4.パッケージファイルのダウンロード先を指定

image.png

5.ダウンロード実行

image.png
clickするとダウンロード開始と終了をお知らせ

image.png

image.png

指定したフォルダにパッケージがダウンロードされていきます。

インストール用のコードを取得

image.png
clickするとコードが表示される

image.png
… (略)
image.png

これをコピペしてスクリプトとして保存しておくと、
オフラインPCでパッケージを導入するときに少しだけ作業が楽になると思います!

まとめ

オフラインPCへのパッケージ導入を支援できればと思って作りました。
勉強にはなりましたが、作り終わった後にインフラ屋さんのためのR言語: 環境構築編にある以下の記述をみて、そっちのほうが楽だなと思いました。

正式な方法かどうかは分かりませんが、手っ取り早い方法としては...
Windows版にパッケージをインストールすると、Rインストールディレクトリ下のlibraryディレクトリにそのパッケージ関連のファイルが展開されます。
なので、Webに接続できるマシン上で必要なパッケージを一通りインストールしてあげて、libraryディレクトリ以下をまるごとzipで固めて対象マシンに持っていって、ディレクトリ毎置き換えてあげます。
とりあえずそれでうまくいってます。

アプリのソースコードはgithubに置きました。
もしよろしければダウンロードして使ってみてください。

実際のパッケージDLはできませんが、アプリの起動だけであれば以下のコードでできると思います、
イメージとして参考にしてください。

console.R
library(shiny)
runGitHub(repo = "DownloadRPackages", username = "sasakiK")

参考

Rオフラインでのパッケージインストール
インフラ屋さんのためのR言語: 環境構築編
elegant-way-to-check-for-missing-packages-and-install-them

2018.06 振り返って考えてみるとDockerで全てが解決する話だなと思います。

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