DNSについて

一回しかアクセスしないよ、という場合でもキャッシュサーバを通すメリット

利点はないです（いろんな意味で）。
この質問の意図は何ですか？

キャッシュのゴミが気になるようでしたらキャッシュの保持期間を短くするなどで対処できるはずですが。

メリットというよりキャッシュ DNS サーバ（フルサービスリゾルバ）を通さないと名前解決ができません。クライアント（スタブリゾルバ）は、権威サーバをルートサーバから辿って名前解決を行う機能を持たず、フルサービスリゾルバに代行させます。