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細菌叢解析ツールの共有〜Dockerコンテナ〜

Posted at 2018-10-01

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はじめに

ひょんなことからとある大会でスライド発表してきました。
では、そちらをご紹介させていただきます。
※大会のスライドを少し省略しております。
※また、がちがちにキンチョーしていたので、こんなフランクには語っておりません。

・NCBIなどの公共データからダウンロードしたデータ。vsearchを利用して解析します。

・解析ツールを構築するためには様々なソフト、パッケージが必要なんです。大変！

・出来た！動いた！　共同研究者よ、君にもどうぞ！
・・・あれ動かない。。。

・Docker様の登場です。

・Dockerのいいところを並べてみました。

・dockerイメージの説明です。いろんなイメージをダウンロードできるのです。おなじみのubuntuやpythonなどの公式イメージもありますよ。

・自分でも作れます！Dockerfileを作成し、ビルドするとDockerイメージになります。

・DockerfleはDockerhubにアップロードします。
・共同研究者や使用したい人がDockerイメージをダウンロードして各々で使用してもらえます！

・はい、みんな幸せ！！

・気になる点&解決策をたらたら・・・（１）

・気になる点&解決策をたらたら・・・（２）

以上です。ありがとうございました！