Automator の中ではユーザーの PATH が反映されないので python コマンドが見つからなくてエラーになっていますね。
スクリプトの1行目に #!/usr/bin/env python
と書いてあると思いますが、ここを絶対パスに変えれば動くようになります。
ターミナルで which python
を実行すると /hoge/fuga/python
のように python の絶対パスが出力されます。それを使って #!/hoge/fuga/python
のように書き換えてください。
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