Galaxy
GalaxyDay 8

公共Galaxyサーバー(微生物以外)

前回は、微生物関連の公共Galaxyサーバーをご紹介しました。今回は、他の公共Galaxyサーバーの一部(リピート配列、化学、融合転写物、コドン、系統解析、RDFに関連)をご紹介します。

RepeatExplorer

真核生物NGSデータにおける反復配列(トランスポゾン)の検出。

Chemical Annotation Retrieval Toolkit (CART)

化学物質アノテーション検索

ChimeRScope

トランスクリプトーム配列(RNA-seq)データにおける融合遺伝子の検出

Codon Harmonizer

異種遺伝子発現のためのコドン改変

kmer-SVM

サポートベクターマシン(SVM)を使用

MGEScan

真核生物ゲノム配列中の長い末端反復 (Long terminal repeat, LTR) を同定

Osiris

系統解析

PIA

系統解析

RDF2Graph

RDF2Graph recovers the structure of an RDF resource.