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GalaxyDay 23

Galaxyの公共サーバ(微生物 microbe 以外)

Galaxyの公共サーバの(概要)(微生物解析用)をご紹介しました。今回は、他の公共サーバ(リピート配列、化学、融合転写物、コドン、系統解析、RDFに関連)をご紹介します。


kmer-SVM

サポートベクターマシン(SVM)の特徴量としてDNA配列のオリゴマー(kmer)を用いた転写因子結合部位の予測


Langille Lab

PICRUStのサーバ。マーカー遺伝子(例えば、16S rRNA)と全ゲノムからメタゲノムの機能を予測するバイオインフォマティクス・ソフトウェア・パッケージである。


MGEScan

真核生物ゲノム配列中のレトロトランスポゾンを同定