Galaxyの公共サーバの（概要）と（微生物解析用）をご紹介しました。今回は、他の公共サーバ（リピート配列、化学、融合転写物、コドン、系統解析、RDFに関連）をご紹介します。
kmer-SVM
サポートベクターマシン（SVM）の特徴量としてDNA配列のオリゴマー（kmer）を用いた転写因子結合部位の予測
- Public server: kmer-SVM server
- チュートリアル A tutorial on using the web server
- 論文 Fletez-Brant et al. Nucleic Acids Res. 2013 "kmer-SVM: a web server for identifying predictive regulatory sequence features in genomic data sets."
Langille Lab
PICRUStのサーバ。マーカー遺伝子（例えば、16S rRNA）と全ゲノムからメタゲノムの機能を予測するバイオインフォマティクス・ソフトウェア・パッケージである。
- Public server: Langille Lab PICRUSt server
- ドキュメンテーション PICRUSt Documentation
- 論文 Langille et al. Nat Biotechnol. 2013 "Predictive functional profiling of microbial communities using 16S rRNA marker gene sequences."
MGEScan
真核生物ゲノム配列中のレトロトランスポゾンを同定
- Public server: Langille Lab PICRUSt server
- User Support
- チュートリアル MGEScan on Galaxy QuickStart Tutorial
- ドキュメンテーション MGEScan documentation
- 論文 Lee et al. Bioinformatics. 2016 "MGEScan: a Galaxy-based system for identifying retrotransposons in genomes."
