ユーザデータ

ユーザデータとは、EC2初回起動時に動作するスクリプトを登録できる設定です。
sshポート変更など、サーバ構築後によくやる作業を設定しておくと
初回起動時点に環境に反映してくれます。
設定方法は以下。

EC2の停止
対象インスタンスを右クリック＞インスタンスの設定＞ユーザーデータの表示/変更

上記のように実行したいスクリプトを記載できます。

ただ、ユーザデータはインスタンス構築後の初回起動時のみしか実行されません。

再起動時もユーザデータを動作させる方法

MIMEマルチパートファイルを使用して、ユーザデータの実行頻度を起動の都度に変更できます。
参考：https://aws.amazon.com/jp/premiumsupport/knowledge-center/execute-user-data-ec2/

ユーザデータに以下を張り付けてください。
★部分が実際に実行するスクリプトなので、ここだけ変えればOKです。

Content-Type: multipart/mixed; boundary="//"
MIME-Version: 1.0

--//
Content-Type: text/cloud-config; charset="us-ascii"
MIME-Version: 1.0
Content-Transfer-Encoding: 7bit
Content-Disposition: attachment; filename="cloud-config.txt"

#cloud-config
cloud_final_modules:
- [scripts-user, always]

--//
Content-Type: text/x-shellscript; charset="us-ascii"
MIME-Version: 1.0
Content-Transfer-Encoding: 7bit
Content-Disposition: attachment; filename="userdata.txt"
★↓
#!/bin/bash
/bin/echo "Hello World" >> /tmp/testfile.txt
--//

これでEC2起動の都度、スクリプトを実行できます。