はじめに
以前この記事を書いたのですが、せっかくなんで何か公開しようと思い、これ💩これは世界一の臭いであるウンコードを出力します💩をみて思いつきで作ってみました。
つくったもの
つくったものはこれ（http://adventam10.php.xdomain.jp/dna/index.php）
機能
- 入力した文字を塩基配列に変換してくれる
- 塩基配列を文字に変換してくれる
左が入力文字、右が変換後です。上のラジオボタンでモードを選択します。
文字→塩基配列
塩基配列→文字
仕組み
仕組みは単純で文字を一度4進数に変換し、その後それぞれの数字を塩基に置き換えているだけです。
💩これは世界一の臭いであるウンコードを出力します💩この記事を読んで、一度バイナリに変換したら全ての文字を２文字で表現できるのか！と思い作ってみました。
PHPで作っておりbin2hexで一度文字を16進数に変換し、その後4進数に変換しています。
16→4進数の変換はbase_convertでできるかと思ったのですが、大きな数値は変換できず「あいうえお」でさえ変換できなかったのでPHPマニュアルに書いてあったconvBaseでどうにか実現できました。
gmp_strvalを使えばできるというのもみたのですがXFREEサーバーへの導入方法がわからず（そもそも導入可能なのか？）convBaseで落ち着きました。
さいごに
生命科学を履修した身としてどうにか活かせないかと苦悩し、今回この塩基配列変換ツールを作成しました。
この塩基配列変換ツールがどなたかの役に立つことを心より願っております。
当初はアミノ酸までしてやろうと思ったのですが、非可逆になってしまうので断念しました...