概要
npm@5.7.[01] で npm pack や npm publish して作成されるtgzの中のファイルのタイムスタンプがおかしいのでご注意ください
npm@5.7.1
npm@5.7.0 も同様です。
% npm -v
5.7.1
% npm pack
nroonga-0.3.1.tgz
% tar -ztvf nroonga-0.3.1.tgz
-rw-r--r-- 0/0            1035 1970-01-01 09:00 package/package.json
-rw-r--r-- 0/0             561 1970-01-01 09:00 package/binding.gyp
-rw-r--r-- 0/0           60927 1970-01-01 09:00 package/npm-shrinkwrap.json
-rw-r--r-- 0/0            2380 1970-01-01 09:00 package/README.md
-rw-r--r-- 0/0             488 1970-01-01 09:00 package/examples/prompt.coffee
-rw-r--r-- 0/0             283 1970-01-01 09:00 package/examples/test.js
-rw-r--r-- 0/0              80 1970-01-01 09:00 package/lib/nroonga.js
-rw-r--r-- 0/0           26530 1970-01-01 09:00 package/license/lgpl-2.1.txt
-rw-r--r-- 0/0            7935 1970-01-01 09:00 package/src/nroonga.cc
-rw-r--r-- 0/0            1394 1970-01-01 09:00 package/src/nroonga.h
-rw-r--r-- 0/0            6954 1970-01-01 09:00 package/test/database.test.js
npm@5.6.0
% npm -v
5.6.0
% npm pack
nroonga-0.3.1.tgz
% tar -ztvf nroonga-0.3.1.tgz
-rw-r--r-- 0/0            1035 2018-03-20 10:31 package/package.json
-rw-r--r-- 0/0             561 2017-09-22 14:51 package/binding.gyp
-rw-r--r-- 0/0           60927 2018-03-20 10:31 package/npm-shrinkwrap.json
-rw-r--r-- 0/0            2380 2017-10-04 09:48 package/README.md
-rw-r--r-- 0/0             488 2017-08-14 11:03 package/examples/prompt.coffee
-rw-r--r-- 0/0             283 2017-09-22 14:12 package/examples/test.js
-rw-r--r-- 0/0              80 2017-09-25 10:19 package/lib/nroonga.js
-rw-r--r-- 0/0           26530 2017-08-14 11:03 package/license/lgpl-2.1.txt
-rw-r--r-- 0/0            7935 2018-03-22 13:54 package/src/nroonga.cc
-rw-r--r-- 0/0            1394 2018-03-22 13:54 package/src/nroonga.h
-rw-r--r-- 0/0            6954 2017-10-02 14:42 package/test/database.test.js
まとめ
npm publish するときは npm@5.6.0 などで行うのが良さそう
追記: 2018-08-30 最新のnpmではこの問題は解決済なので最新のnpmを使うのが一番良いです
追記2: 2018-08-30 こちらのコメントもご参照ください