シングルセル発現解析用のFastqファイルの整形

データベースで公開されているilluminaパイプライン由来のsraデータをfasterq-dumpでfastqにしたのですが、ここから10xのcellrangerのパイプラインに乗せ換えれるようにfastqを整形する方法ってありますか？illuminaのサポートにBaseSpaceの有料のツールを勧められましたが有料なので手を出したくないです。