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オープンソース版PyMOLの外観をバイナリ版のそれに近付ける

Last updated at Posted at 2021-02-24

分子描画ソフトウェアのPyMOLには公式のバイナリ(Incentive ver.)を利用してインストールしたものと、Schrödinger, Inc.のGitHubに置かれているオープンソース版を使ってインストールしたものの2種類があります。
機能は95%くらい同一になるよう設定されているようですが、公式のバイナリ版の方が少し機能が拡張されている代わりに、その機能を使うためには有料またはEducationalのライセンスを取得するよう促してくる形になっています。

普段使いする分にはオープンソース版を使う(Windows版: https://qiita.com/Ag_smith/items/a9670bfd79fb3bf39975; macOS/Linux版: https://qiita.com/Ag_smith/items/58e917710c4eddab46ee) と良いのですが、少々気になるのが見た目の問題です。

macOS版の場合、公式バイナリ版(Educational licenseを使用)はこんな感じ
スクリーンショット 2021-02-25 2.22.00.png

オープンソース版はこんな感じ
スクリーンショット 2021-02-25 2.21.42.png

上1/3のExternal GUI部分の見た目がこのように違っています。

この外観は、実は簡単に変更することができます。macOSでバイナリ版の場合は/Applications/PyMOL.app/Contents/share/pymol/data/pmg_qt/styles/pymol.styに、オープンソース版の場合は$(brew --prefix)/opt/pymol/libexec/lib/python3.13/site-packages/pymol/pymol_path/data/pmg_qt/styles/pymol.styというファイルで規定されています。

オープンソース版のpymol.styファイルを開いてみると

#builder QPushButton
{
    padding:        1px 3px;
}

QPushButton[quickbutton=true]
{
    padding:        1px 5px;
}

QMainWindow::separator
{
    width:          5px;
    height:         5px;
    border:         none;
}

/* vi:ft=css:expandtab:sw=4
 */

という内容になっていますが、バイナリ版のそれは結構色々書き込まれています(ここでは内容を紹介しません)。

ということで、オープンソース版のpymol.styの中身をバイナリ版のpymol.styファイルの中身で上書きすることで、バイナリ版の外観に近付けることができます。以下はmacOSでのコマンドの例です。($(brew --prefix)を使うことでHomebrewのインストール場所を自動検知しています)

cp /Applications/PyMOL.app/Contents/share/pymol/data/pmg_qt/styles/pymol.sty $(brew --prefix)/opt/pymol/libexec/lib/python3.13/site-packages/pymol/pymol_path/data/pmg_qt/styles/

このコマンドを実行し、pymolを再起動してみた結果がこちら。

スクリーンショット 2021-02-25 2.36.25.png

External GUIの外観がバイナリ版のそれにかなり近づきました。macOSのダークモードを適用していない状態でExternal GUIのメッセージログが黒背景に白文字になっているところがポイントです。
Windows, Linux版でも同様に該当するpymol.styファイルを探し出して編集すれば同様の効果が期待されます。

pymol.styファイル自体はcssの文法に従っているところが大きいみたいなので(正確にはQt5のスタイルシート)、これを読めばさらに外観を変更することができます。

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