デバッグしていて思い出したのでメモ
#1 Derived Dataを消す
ググると一番多く出てくる解決策
こちらを参考に実行
swift - "The file "MyApp.app" couldn't be opened because you don't have permission to view it" when running app in Xcode 6 Beta 4 - Stack Overflow
http://stackoverflow.com/questions/24924809/the-file-myapp-app-couldnt-be-opened-because-you-dont-have-permission-to-vi
でも動かなかった(´・ω・`)
#2 Build PhasesのCompile Sourcesにmain.mファイルを追加
これで解決
その他の必要な.mファイルも消えている可能性があるのでチェック