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製薬企業で使えるPythonライブラリのインストール方法

Last updated at Posted at 2019-12-15

はじめに

製薬企業研究者のためのPythonインストール方法で紹介したようにAnacondaをインストールすると、科学計算に使うライブラリはおおむねインストールできるのですが、機械学習などで使われるライブラリやモジュールの一部はまだインストールされていません。
そこで、追加でいくつかライブラリやモジュールをコマンド プロンプトを用いてインストールします。
Python3系の使用を想定しています。

化学系

RDkit

化合物の構造情報などを扱えます。
https://www.rdkit.org/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c rdkit rdkit

データベース操作

SQL Alchemy

データベース操作を行うことができます。
https://www.sqlalchemy.org/
インストールするには、以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge sqlalchemy

機械学習関連

TensorFlow

深層学習(ディープラーニング)を行うためのライブラリです。
https://www.tensorflow.org/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge tensorflow

Keras

TensorFlow上で動くニューラルネットワークのライブラリです。
https://keras.io/ja/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge keras

OpenCV

画像解析に使えるライブラリです。
https://opencv.org/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge opencv

Scrapy

ウェブスクレイピングを本格的に行うときに使えます。
https://scrapy.org/
インストールするには、以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge scrapy

まとめ

ここでは、Anacondaをインストールした後に追加でインストールするライブラリやモジュールのインストール方法について解説しました。
ここで取り上げたもの以外のライブラリをインストールするためのコマンドは、Anaconda Cloudで検索すると分かります。

参考資料・リンク

プログラミング言語Pythonとは?AIや機械学習に使える?

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