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ツール開発の資料を見よう

日本語の分かりやすい資料があります！

planemoにはGalaxyツール開発に必要なツールが一通り入っています。planemoのDocker環境上でツールを開発するのが一番楽です。

ホスト側にツール開発用のディレクトリを作成し、このディレクトリ上から以下のコマンドでDockerを立ち上げる。

$ docker run --name planemo -p 9090:9090 -v `pwd`:/opt/galaxy/tools planemo/interactive

ホスト側のカレントディレクトリが、コンテナ内の/opt/galaxy/toolsにマウントされる。

$ docker exec -it planemo /bin/bash
$ source /home/ubuntu/planemo-virtualenv/bin/activate
$ cd /opt/galaxy/tools

Building Galaxy Tools Using Planemoのチュートリアルを試してみる。