最新のflashromはビルドがmesonになったので、El Capitanでビルドしてあったv1.2をコピーして実行してみました。
$ ./flashrom -p ft2232_spi:type=232H
flashrom v1.2 on Darwin 17.7.0 (x86_64)
flashrom is free software, get the source code at https://flashrom.org
Calibrating delay loop... OK.
Found Macronix flash chip "MX25L6405" (8192 kB, SPI) on ft2232_spi.
Found Macronix flash chip "MX25L6405D" (8192 kB, SPI) on ft2232_spi.
Found Macronix flash chip "MX25L6406E/MX25L6408E" (8192 kB, SPI) on ft2232_spi.
Found Macronix flash chip "MX25L6436E/MX25L6445E/MX25L6465E/MX25L6473E/MX25L6473F" (8192 kB, SPI) on ft2232_spi.
Multiple flash chip definitions match the detected chip(s): "MX25L6405", "MX25L6405D", "MX25L6406E/MX25L6408E", "MX25L6436E/MX25L6445E/MX25L6465E/MX25L6473E/MX25L6473F"
Please specify which chip definition to use with the -c <chipname> option.
使えるみたいなので、おそらくもうビルドはしません。
自力でビルドするのは非現実的でbrewを使うのがいいのかもしれません。