更新
現在は公式で Bundler 2 に対応しているので、本記事の内容は古くなっています。
デフォルトの Buildpack に戻すには下記が参考になります。
[heroku] bundler 2.0+ をつかえるようにbuildpackをカスタムしていてpushが弾かれた話 - Qiita
https://qiita.com/hirocueki2/items/4da0ff2f6e8d2f8002c3
古い内容
Heroku の公式の Ruby buildpack では Bundler のバージョンが 1.15 なので、Bundler 2 で作成した Gemfile は現時点ではビルドに失敗してしまう。
Heroku が公式に対応するまでの間に Heroku で Bundler 2 を使いたい場合は、Bundler チームが作成した bundler/heroku-buildpack-bundler2 を利用することができる 1。
ただし、これは Heroku が公式にサポートする buildpack ではなく、Bundler チームからのサポートも限られているため、production で使用するには事前にテストすることが強く推奨されている 2。
# Buildpack を入れ替える
heroku buildpacks:set https://github.com/bundler/heroku-buildpack-bundler2.git
# 次回デプロイ以降 Bundler 2 が利用される
git push heroku master