IEで開いたはずなのにEdgeで表示されるのを回避

Edgeの設定を開き、internetで検索。
以下設定を確認。

Internet Explorer に Microsoft Edge でサイトを開かせる

IEからEdgeを起動するaタグの書き方

<a href="microsoft-edge:https://qiita.com/">EdgeでQiitaを開く</a>

HKEY_CLASSES_ROOT\note\shell\Open\command
が命令になるので、
HKEY_CLASSES_ROOT\microsoft-edge\shell\Open\command を上書きすればコントロールできるかも。