Mavericksで2015-004をインストールしたらSSL証明書がおかしくなる件と同様の症状で困っていた
App Storeにも接続できず、なんとかUPDATEする方法がないかと思いしらべたところコマンドラインでMac OS XをUPDATEする方法があった

rootシェルになる

$ sudo -s

アップデートの確認

# softwareupdate --list

アップデート内容の例

Software Update Tool
Copyright 2002-2012 Apple Inc.

Finding available software
Software Update found the following new or updated software:
   * RemoteDesktopClient-3.8.3.1
	Remote Desktop クライアントアップデート (3.8.3.1), 7103K [recommended]
   * Mac EFI Security Update 2015-001-1.0
	Mac EFI セキュリティアップデート 2015-001 (1.0), 102537K [recommended] [restart]
   * Safari7.1.8Mavericks-7.1.8
	Safari (7.1.8), 59703K [recommended]
   * SecUpd2015-006Mavericks-1.0
	セキュリティアップデート 2015-006 (1.0), 250883K [recommended] [restart]
   * iTunesX-12.2.2
	iTunes (12.2.2), 221488K [recommended]

アップデート

# softwareupdate --install 'SecUpd2015-006Mavericks-1.0'

アップデートの実行結果

Software Update Tool
Copyright 2002-2012 Apple Inc.

Finding available software

Downloaded セキュリティアップデート 2015-006
Installing セキュリティアップデート 2015-006
Done with セキュリティアップデート 2015-006
Done.

You have installed one or more updates that requires that you restart your
computer.  Please restart immediately.

これで再起動したらApp Storeなども表示できるようになった

参考文献