Macでは日本語の入力がトグル式ではなく、スペースキーの左右のキーで制御されています。右がON、左がOFFとなっています。Windowsでもそのうちにこちらが標準になりそうですね。( http://www.itmedia.co.jp/news/articles/1812/26/news094.html )

UbuntuにおいてFcitxを利用してる場合には設定で行うことができます。

メニューから「Fcitx設定」をクリックし設定アプリを起動します。

Show Advanced Option をクリックします
入力メソッドをオンに、オフにのキーを設定します。

ALT/Winキーを入れ替えていますので画面では「Rsuper/Lsuper」になっています。（Macに近づけるため）これはキーボードレイアウトのオプションで行うことができます。
Winキーをショートカットにすると、デスクトップマネージャーのメニューが先に反応してしまうのでそちらのショートカットをオフにしています。