Windowsでも、Pythonのpyenvのように、Rubyでも仮想環境（実行環境の切り替え）を使えるものだと思ってましたが、Ubuntu同様簡単に使えると高をくくっていた私には意外にハードルが高く、少し手間がかかりました。

（補足）MSYS2を使っているのは個人的な好みです。

概要

Windows(MSYS2)でrbenvを使おうとしたら、大きく以下の問題をクリアする必要がありました。

src/realpath.cがコンパイルエラーになる
rbenvにパスが通らない
libexe/rbenv-*を呼び出してくれない
ruby-buildでrubyがビルドできない（未だ原因不明）

Ubuntu等でのrbenvのインストール方法（ご参考）

普通？は、これでうまくいくはずです。ところが、Windowsではそう甘くありませんでした。

$ git clone https://github.com/rbenv/rbenv.git ~/.rbenv
$ cd ~/.rbenv && src/configure && make -C src
$ git clone https://github.com/rbenv/ruby-build.git ~/.rbenv/plugins/ruby-build
$ ~/.rbenv/plugins/ruby-build/install.sh

問題１の解決

ダウンロード(git clone)後、realpath()が無い様でmake -C srcがエラーになります。

$ cd ~/.rbenv && src/configure && make -C src
make: ディレクトリ '/home/Taro/.rbenv/src'　に入ります
gcc -fPIC     -c -o realpath.o realpath.c
realpath.c: In function 'realpath_builtin':
realpath.c:18:13: warning: implicit declaration of function 'realpath'; did you mean '_makepath'? [-Wimplicit-function-declaration]
   realbuf = realpath(p, NULL);
             ^~~~~~~~
             _makepath
realpath.c:18:11: warning: assignment makes pointer from integer without a cast [-Wint-conversion]
   realbuf = realpath(p, NULL);
           ^
gcc -shared -Wl,-soname,../libexec/rbenv-realpath.dylib  -o ../libexec/rbenv-realpath.dylib realpath.o
realpath.o:realpath.c:(.text+0x3f): undefined reference to `realpath'
collect2.exe: error: ld returned 1 exit status
make: *** [Makefile:22: ../libexec/rbenv-realpath.dylib] エラー 1
make: ディレクトリ '/home/Taro/.rbenv/src' から出ます

realpath()を_fullpath()に置き換えました。正直、rbenvがどう変わったのかわかりませんが、関数の代替はできているはずです。

--- realpath.c  2018-06-10 10:30:30.460637000 +0900
+++ realpath.c.NEW      2018-06-10 10:33:03.433143400 +0900
@@ -15,7 +15,7 @@ WORD_LIST *list;

        for (es = EXECUTION_SUCCESS; list; list = list->next) {
                p = list->word->word;
-               realbuf = realpath(p, NULL);
+               realbuf = _fullpath(NULL, p,_MAX_PATH);
                if (realbuf == NULL) {
                        es = EXECUTION_FAILURE;
                        // builtin_error("%s: cannot resolve: %s", p, strerror(errno));

問題２の解決

ビルド後に（パスを通して）、rbenvとしてもエラーになりました。

$ ~/.rbenv/bin/rbenv init
.rbenv/bin/rbenv: 行 1: ../libexec/rbenv: No such file or directory
$ file ~/.rbenv/bin/rbenv
.rbenv/bin/rbenv: ASCII text, with no line terminators
$ rm ~/.rbenv/bin/rbenv
$ ln -s ../libexec/rbenv .

問題３の解決

MSYS2はインストール直後は、シンボリックリンクは使わない設定のようです。シンボリックリンクが使えないと（なぜか）libexec/rbenv-*が呼び出せないようです。

msys64/msys2_shell.cmd中の記述を変更して、シンボリックリンクを使えるように変更します。

変更前

rem set MSYS=winsymlinks:nativestrict

変更後

set MSYS=winsymlinks:nativestrict

問題４の解決

ruby-buildを入れて所望のバージョンをインストールしようとしましたが、エラーになりました。これは原因がわからず断念しました。

GitHubのoneclick/rubyinstaller2から所望のバージョンの7zファイルをダウンロードして、.rbenv/versions下に解凍して使いました。

環境

Windows 10 Pro 1803 ビルド17134.48
MINGW64_NT-10.0 DESKTOP-NAME 2.10.0(0.325/5/3) 2018-02-09 15:25 x86_64 Msys
rbenv 1.1.1-37-g1c772d5