条件付き書式はテーブルみたいな列名付与ができないのでパッと見で数式がわかりづらいだけでなく、似たような判定式を複数作っているとどれがどれか分からなくなりますよね。

さらにコピペで増殖された日には改修する気が一気に失せます。

そこで関数にコメントを入れる方法を使えばまだマシにできないかと試したところ、参照セルの見づらさは改善できないまでも意図は分かりやすくすることができました。

IF関数のFALSEを使ってコメント化する

=IF(論理式,TRUE,"コメント")
とするだけで条件付き書式に意味をつけられます。
素晴らしい。

N関数を使ってコメント化する

もちろんN関数も使えます。

=N("コメント")+論理式

ここで注意すべきは&ではなく**+**で結合するところです。

基準値	評価値
0.48	0.56

=N("コメント")&$A2	=N("コメント")+$A2
00.48	0.56

&でつなげると、「00.65なんぞ」とExcelがご認識してしまいます。
数値なので+

対象文字列	KW
エクセル	セル

あいまい検索時には結局COUNTIFが吐いた数値で評価するので=N("コメント")+論理式という形は変わりません。

対象文字列	KW
エクセル	エクセル

今度はT関数で挟んでやります。
T(N("コメント"))&論理式となり、+ではなく&でつないでいます。

結論、コメントをつけたい位置によって使い分ければいい気もしますが、

N関数は+だの&だのT関数で挟む挟まないだの場合分けが必要なので
IF関数が万能で書きやすいかな、という印象です。

ただ、数式が長くなってコメントが後ろにいくと見えないよ、というときは頑張ってN関数で書くしかないですね。